Jyväskylän yliopiston puhallinorkesteri Puhkupillit on perustettu vuonna 1983. Tärkeitä alullesaattajia olivat Jyväskylän yliopiston hallintojohtaja Matti Hietala, yliopiston ylioppilaskunnan, JYY:n, kulttuurisihteeri Artsi Hietakangas sekä Puhkupilleistä Ilkka Koski, kapellimestari Harri Mäntynen ja puheenjohtaja Joni Palomäki. Orkesterin hallinnollista puolta hoitava yhdistys perustettiin hieman myöhemmin, vuonna 1988. Puhkupillien ensiaskeleet otettiin kapellimestari ja orkesterin perustajajäsen Harri Mäntysen ohjauksessa. Ensimmäiset kappaleet lainattiin Jyväskylän TY:n puhallinorkesteri Kajastukselta. Soittajat kaipasivat kuitenkin tuoreempia kappaleita perinteisten marssimaisten puhallinmusiikkiohjelmiston tilalle. Ensi hätään kappaleita lainattiin ja haettiin muiden yhteistyöorkestereiden nuotistoista, mutta pian orkesterilla oli jo aivan omiakin sävellyksiä. Tilin avasi Harri Mäntynen Keltinmäki -bluesillaan, perässä tulivat Viitasaaren veljekset Markku ja Jukka. Pian soittokansioissa Perästä kuuluu -blues ja Puhkupilli-boogie syrjäyttivät perinteiset marssit. 1980-luvun lopulla musiikillisen imagon alkaessa löytää omaa suuntaansa myös visuaalista ilmettä haettiin. Ajan vaihtoehtopukeutumisena kehiteltiin keltaiset keikka-asut sekä musta-keltainen logo (Jukka Viitasaaren luomus 1986).

1990-luvun taitteessa orkesterin asenne oli kasvanut tavoitteellisemmaksi ja soittajatkin halusivat esiintyä muualla kuin Ilokivessä (yliopiston monitoimisali) ja vappuna Alvarinaukion Pörssitempauksessa. Ensimmäinen levy Vol.1  äänitettiin 1989 puolivahingossa. Tarkoituksena oli taltioida orkesterin soitantaa omaan käyttöön, mutta äänityssession päätteeksi äänittäjä Seppo Niemi ja orkesterin johtohahmot Markku Viitasaari totesivat että ainesta olisi ihan levyn tekoonkin. Ensimmäinen levy sai LUSESilta (Luovan Säveltaiteen edistämissäätiö) kannustavan kirjeen ja erikoisapurahan, joiden innostamina orkesteri jatkoi toimintaansa ja levyjen tekoa tasaiseen tahtiin.

Vuonna 1988 Suomen Turkuun suuntautunut  ensimmäinen soitannollinen excursio tuotti ahaa -elämyksen: "Emme olekaan yksin, löytyy Suomesta muitakin akateemisia puhallinorkestereita!". Puhkupillien esimerkin siiviittäminä opiskelijaorkestereita oli perustettu  myös Tampereelle (Torvikopla), Joensuuhun (Rytmihäiriköt) ja Vaasaan (VYVO). Keväällä 1990 Teekkaritorvet päättivät järjestää kaikille opiskelijaorkestereille oman tapahtuman Oulussa. Festivaalia päätettiin jatkaa joka toinen syksy eri orkestereiden kotipaikkakuntia kiertäen. Festivaalin nimeksi tuli Puhallus ja se on järjestetty sovitun mukaisesti tuosta vuodesta 1990. Ensimmäinen Puhallus oli Puhkupillien järjestettävänä Jyväskylässä syksyllä 1995 ja seuraava vuoden 2009 syksyllä. Kummatkin olivat orkesterilaisille suuria ponnistuksia, mutta ne vietiin kunnialla läpi.

1990-luku oli aktiivista puhkuaikaa. Orkesteri kehittyi soitannollisesti ja oma tyyli muovautui vahvaksi. Ohjelmisto laajeni kotimaisten omien säveltäjien teosten lisäksi sinfoniseen puhallinmusiikkiin sekä elokuva- ja bilemusiikkin. Puhkuilla oli myös paljon orkesterin ulkopuolista ajanviettoa, mm. oma jalkapallo-, ja tennisvuoro, järjestettiin kesäpäiviä eri paikkakunnille muun kuin soiton merkeissä ja talvisaikaan oli video- ja ruokateemailtoja. Orkesterille perustettiin vuonna 1988 oma lehti, Puhkusika, joka ilmeistyy neljä kertaa vuodessa. Puhkut oli (ja on) tiivis yhteisö, josta löytyi paljon hyviä ystäviä. Erityisesti 90-luvun puhkuissa syntyi lukuisia avo-, ja avioliittoja, ja puhkuhäät kesässä olivatkin vakio. Näistä huippuvuosista häätahti onkin aikalailla hiljentynyt, liekö syynä yhteiskunnan arvotasapainon muutos vai auringonpilkkujen vähyys, tiedä häntä.

Kolmannen levyn, Kolme symbolia, julkaisun jälkeen vuonna 1994 myös muut kuin opiskelijaorkesteritahot alkoivat kiinnostua Puhkupilleistä. Vuonna 1995 meiltä lähti ensi kertaa edustus Puhallinorkesteripäiville sekä Suomen Puhallinorkesteriliiton (Spol) vuosikokoukseen. Valtakunnallisista järjestöistä ja tapahtumista voi luoda uusia kontakteja ja tutustua alan muihin toimijoihin - niin juuri me teimme. Samaisena vuonna orkesteri vieraili ensimmäisen kerran Lieksan Vaskiviikoilla. Ei mitään turhanpäiväistä töräyttelyä vaan taidolla soitettuja keikkoja...vai miten se nyt meni. Kaikkiaan Lieksan kesiä kertyi kuusi kappaletta ja myöhempinä aikoina PuhkuSeniorit ovat hoitaneet Vaskiviikkojen keikkoja.

Yhteistyö ja kontaktien luominen tosiaan kannattaa. Niistä on apua, kun etsitään esim. vuosittaiselle harjoitusleirille vierailevia kapellimestareja. Puhkupillejä ovatkin käyneet vuosien varrella kouluttamassa maamme parhaat puhallinorkesterikapellimestarit, mm. Raine Ampuja, Esko Heikkinen, Petri Juutilainen, Elias Seppälä, Lassi Ikäheimo, Sami Hannula, Jukka Myllys ja Tero Haikala.

2000-luvulle tultaessa Puhkupillejä luotsasivat Nikke Isomöttönen, Janne Ikonen, Tiiu Tuominen ja Marja Ikonen. Tuominen lienee puhkujen pitkäaikaisin kapellimestari; hän viihtyi 12 vuotta tahtipuikon ja yleisön välissä. Orkesterille oli vakiintunut useita lukuvuotta rytmittäviä esiintymisiä kuten Oluen ottajaiset yläkaupungin ravintoloissa Sohwssa ja Ylä-Ruthissa. Myös taiteellinen kevätkonsertti, entisen Jazzbarin nykyisen Popparin bilekeikat kevättalvella ja JYYn vappukeikat olivat varsin varmoina etappeina kalentereissa. Orkesteri täytti 20 vuotta vuonna 2003, jolloin pidettiin suuri juhlakonsertti.

Vuonna 2003 kapellimestarin paikalle astui Marjo Riihimäki. Hänen perässään tulivat puhallinmusiikkipuolella erikoistapaus, nimittäin alttoviulua pääaineenaan opiskellut, sittemmin sivusoitinorkesterissa käyrätorvensoittajana kunnostautunut Leena Toivanen sekä toinen käyrätorvisti Olli-Pekka Hiltunen. Leenan ja O-P:n vispaamisen tahdissa edettiin 25-vuotiskonserttiin asti, jolloin oli taasen juhlan paikka ja haastava ohjelmisto.

Vuonna 2008 kapellimestarin suuriin saappaisiin astuivat Mikko Sateila ja Touko Raatikainen. 25-vuotiskonsertin jälkeen oli hyvä kerätä voimia tulevaan ja seuraavat pari vuotta soitettiin paljon jo olemassa olevaa ohjelmistoa ja tehtiin perinteisiä keikkoja. Mikon lähdettyä opiskelemaan Sibelius-akatemiaan Tanjaana Jaakkola tuli toiseksi kapellimestariksi. Touko ja Tanjaana ovatkin luotsanneet Puhkuja viime vuodet. Jouluna 2010 oli uusi aluevaltaus edessä: pidimme ensimmäisen täysimittaisen joulukonsertin Taulumäen kirkossa. Syksyn Konnevedellä meitä oli kouluttamassa Esko Heikkinen, joka toi mukanaan paljon raikkaita sovituksia tutuista joululauluista. Tiivis harjoittelu kannatti, joulukonsertti oli suuri menestys ja ehdottomasti uusimisen arvoinen!

Syksy 2011 käynnistyi normaaliin tapaan. Orkesteri keikkaili ahkerasti kauden aikana. Alkusyksystä Puhkupillit oli mukana TATTOO 2011 -tapahtumassa Jyväskylässä Synergia-areenalla. Lisäksi orkesteri on soittanut Yläkaupungin Oluenottajaisissa ja järjestänyt itse joulukonsertin Taulumäen kirkossa.

Keväällä 2012 orkesteri keräsi varoja Puolan-konserttimatkaa varten Popparin bilekeikalla, Peukkulan lastenkonsertilla sekä lukuisilla pienemmillä esiintymisillä. Matkaanlähtökonsertti pidettiin toukokuussa.